La primera referencia sobre regatas de traineras en Santoña se remonta al 9 de septiembre de 1901. Ése día, por iniciativa de la Reina María Cristina de Habsburgo, se celebraron regatas en la bahía. Cuatro meses antes, una trainera de pesca había naufragado, perdiendo la vida todos sus tripulantes. A sus familiares les quedó un subsidio de cuatro meses, pero, agotado este plazo, las familias de los náufragos quedaron sin sustento. Por ello se puso en marcha una iniciativa editorial, en la que participaron escritores relevantes de la época como Concha Espina y Menéndez Pelayo, con el fin de recaudar fondos con destino a estas familias. Se editó una publicación, que se puso a la venta. La Reina María Cristina tuvo conocimiento de estos hechos y decidió promover la celebración de un acontecimiento para conmemorarlo. Ese acontecimiento fue la celebración de una regata entre traineras de la bahía, competición que tuvo lugar el 9 de septiembre de 1901.

En 1919, una trainera de Santoña participa por vez primera en las Regatas del Nervión. En representación de Cantabria asisten Santoña, Santander y Laredo. Fue la primera vez en que traineras de fuera de Vizcaya participaron en las regatas del Nervión. Ganó San Sebastián.

En 1925, tras diversos éxitos de Santoña y Argoños en las regatas celebradas en la Bahía de Santander con ocasión de las visitas del Rey Alfonso XIII, se conforma una tripulación compuesta por remeros de uno y otro puerto con el fin de participar en las Regatas de La Concha. Lo hicieron con el nombre de Santoña, a bordo de una embarcación denominada 'Cuba', pues sufragada con dinero enviado por indianos residentes en la isla. Tomó parte en las Regatas de La Concha y ocupó la quinta plaza. Ganó Orio.

Tras la Guerra Civil, el remo cántabro asiste a los primeros duelos entre Pedreña y Peñacastillo, cuyo resultado fue tres victorias de Pedreña en las Regatas de La Concha (1945, 1946 y 1949) y otras tantas en el Campeonato de España de traineras (1944, 1947 y 1948). Esos años, Santoña participa en la competición regional de traineras.

El remo cántabro se desmantela tras la temporada 1950 y no vuelve a salir al agua ninguna tripulación hasta catorce años después. En 1964 se recuperan las regatas de traineras y se celebra una primera edición del Campeonato Provincial en el que Pedreña, Peñacastillo y Santoña son los únicos participantes. Para entonces, Santoña se ha convertido, ya, en un clásico: siempre que ha habido regatas de traineras de Cantabria, Santoña ha tomado parte en la competición, con mejores o peores resultados.

Los años 70 son los años de los primeros éxitos. En 1973, Santoña se proclama campeón de España de bateles, en Pasajes de San Pedro, y subcampeón de España de trainerillas, en Luanco. En esta modalidad, sólo le gana Michelín de Lasarte. En trainera, ésa misma temporada, ocupa la cuarta plaza en el Campeonato de España, por detrás de Orio, Michelín de Lasarte y Astillero.

Santoña compite en trainera en los años 1972, 1973, 1974 y 1975, con el nombre de Santoña OJE. Después, el club se reconvierte, cambia su nombre (pasa a denominarse Sociedad Deportiva Santoña Club de Remo), cambia de colores (adopta el distintivo azul, con banda roja y blanca) y se dedica por completo a la práctica del banco móvil.

En 1983 se produce el regreso a la competición de trainera, con remeros formados en la disciplina de banco móvil. Los años 80 le proporcionan a Santoña tres títulos regionales de trainera (1986, 1987 y 1988), tres participaciones en las Regatas de La Concha (1984, 1986 y 1989) y numerosas banderas. En bateles se adjudica los campeonatos de 1986 y 1987, así como el subcampeonato de trainerillas de 1986. En banco móvil, Santoña gana en 'ocho con' la final del Campeonato de España de 1987.

Durante esos años, Santoña proporciona numerosos remeros a la selección española de remo: Chechu Vinatea, Fernando Vinatea, Roberto de Llanos y Florián Merchán.

Entre 1983 y 1989, Santoña compite en trainera de manera ininterrumpida. No lo hace en 1990, pero regresa en 1991 para continuar hasta 1996.

En los años 90 Santoña gana el Regional de traineras de 1995 y 1996. También se proclama campeón de España de trainerilla en categoría juvenil, en la temporada 1991.

Desde 1996 hasta ahora, las participaciones han sido intermitentes. Sale en 1997 formando un combinado con Santander y en solitario en 1999. Compite en el 2001, 2002 y 2003, y ahora vuelve a hacerlo al inscribirse para la Liga ARC 2 de 2009.

S.D. Santoña Club de Remo